巴氏殺菌后，由于啤酒在加熱時(shí)膨脹，瓶子內(nèi)部會產(chǎn)生相當(dāng)大的壓力。啤酒膨脹減少了充滿二氧化碳的瓶頸空間，二氧化碳的壓縮增加了瓶內(nèi)的壓力。當(dāng)然，只能壓縮氣體，不能壓縮液體。因此，這部分CO2具有重要的保護(hù)作用。
為減少巴氏殺菌過程中爆瓶的損失，啤酒灌裝時(shí)必須嚴(yán)格控制啤酒液面高度，瓶頸的排空量不應(yīng)小于瓶容的5%，否則會因壓力過大而導(dǎo)致爆瓶。 -- 一般而言，巴氏殺菌過程的破損率應(yīng)小于0.1%至0.2%。如果超過這個(gè)值，就要引起足夠的重視，并立即采取措施。
一般來說，隧道式巴氏殺菌機(jī)也存在一定的問題。例如，當(dāng)設(shè)備出現(xiàn)故障或其他原因停機(jī)時(shí)，如果不及時(shí)取出機(jī)器內(nèi)的瓶子，啤酒殺菌機(jī)組可能會超出規(guī)定要求。過度的巴氏殺菌會給啤酒帶來明顯的“巴氏殺菌味”（類似于面包味），會大大降低啤酒的口感品質(zhì)。
此外，隧道滅菌器占地面積大，能耗高。但在一些產(chǎn)品的生產(chǎn)中，它是必不可少的設(shè)備。為了提高其經(jīng)濟(jì)性，需要平衡殺菌單元、殺菌溫度、出口溫度和單位噴淋量等各參數(shù)之間的關(guān)系。既保證了可靠的產(chǎn)品質(zhì)量，又有效的節(jié)能降耗，以最大限度地降低設(shè)備成本和運(yùn)行成本，提高企業(yè)的經(jīng)濟(jì)效益。

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